Molekulaardiagnostika
Probleemiks: koopiate arv genoomis,
heterosügootsus ja ploidsus.
8) PCR meetodite detektsioonipiir ja kvantiseerimispiir. Konkreetselt.
Detektsioonipiir (limit of detection, LOD) on kõige väiksem usaldusväärselt detekteeritav
kogus (mis ei pea tingimata olema kvantiseeritav). ENGL kriteeriumide järgi loetakse GMO-de
määramisel sobivaks meetod, mille LOD < 1/20 spetsifikatsiooni väärtusest standardhälbe £ 30%
korral.
Näiteks: 1% nominaalväärtuse korral on LODmin = 0,05% või siis 500 koopia LODmin = 25
koopiat.
Analüütilise protseduuri kvantiseerimispiir (limit of quantification, LOQ) on kõige väiksem
usaldusväärselt kvantiseeritav kogus. ENGL kriteeriumide järgi loetakse GMO-de määramisel
sobivaks meetod, mille LOQ < 1/10 spetsifikatsiooni väärtusest standardhälbe £ 25% korral.
Näiteks: 1% nominaalväärtuse korral on LOQmin = 0,1% või siis 500 koopia LOQmin = 50
koopiat.
1. Mis on geneetiliselt muundatud organismid?