Molekulaarbioloogia aruanne
23.DNA lahutamine agaroosgeelis
24. Eesmärgiks on visualiseerida oma produkti ning hinnata selle suurust. DNA lahutamisel
kasutatakse agaroosi (disahhariid, koosneb D-galaktoosist ja 3,6-anhüdro-L-galaktoosist).
1. päev: kasutatava agaroosgeeli kangust arvutatakse võttes arvesse oodatava produkti pikkust.
Meie kasutasime 1% geeli. Segasime kokku 100 ml TAE puhvrit, 1 gr agaroosi ning
kuumutasime mikholaineahjus sulamiseni. Jahtunud geelisegule lisasime1 μl EtBr, mida
kasutatakse DNA visualiseerimiseks. Valasime lahus geelialusele ning jätsime tarduma
järgmise praktikumini.
2. päev: lisasin PCR segule 4 μl 6x DNA värvi, et DNA nähtav oleks, ning kandsin kogu segu
TAE geelile (hambasse). DNA lahutamine toimub elektrivoolu toimel (100 V 15 min)
25.
26.
27.
28.
29.
30. Kuna minu produkt ei ole üldse geelipildil nähtav, võin järeldada, et midagi tegin valesti PCR
reaktsiooni teostamisel (nt