"liigikogumi" - 1 õppematerjal

Biosüstemaatika teooria ja meetodid

8.11. Arvutiprogrammile võib "ette kirjutada" ka mitmesuguseid piiran- guid ja "sundkäike". Võime nõuda, et teatud liigid või liigirühmad peavad olema ühes harus (klaadis) koos; et teatud rühmad peavad olema kõrvutistes sõsarokstes (harudes). Sellised "sundused" (constraints) on tavaliselt õi-  24 gustatud ainult siis, kui need tuginevad mõnel eelnenud kladistilisel ana- lüüsil uuritava liigikogumi osahulga kohta. 8.12. Puu ehitamise mistahes algoritm (programm) püüab minimeerida puu pikkust, s.t. vältida homoplaasiat - paralleelsust ja tagasipöördumist. Iga saadud puu puhul arvutab programm iga tunnuse kohta selle püsivusindeksi (consistency index); kui tunnus on muutunud ainult üks kord, on selle väär- tus 1. Mida rohkem on reversioone ja paralleelsust, seda väiksem on indeksi väärtus; seda pikem sammudes tuleb ka puu. Kõigi tunnuste peale kokku ise-