On sensitiivne ((90–95%) ja spetsiifiline (98%) konjunktiivilt ja sümptomaatiliste meeste ureetrast võetud materjali uurimisel. Mikroskoopiat ei soovitata asümptomaatiliste patsientide skriininguks (sensitiivsus 50–75%) ning farüngeaalsete ja rektaalsete proovide hindamiseks. Sümptomaatilistel naistel on mikroskoopia sensitiivsus tunduvalt madalam -37– 50% endotservikaalse ja 20% ureetra materjalide puhul. Tavaliselt teostatakse algmaterjali värvimine paralleelselt Grami ja Leishman-Giemsa meetodil. MOLEKULAARSED MEETODID. Põhiline diagnostiline meetod. On olemas erinevad kommertsiaalsed testid, mis võimaldavad määrata uuritavast materjalist korraga nii N. gonorrhoeae’d kui ka Chlamydia trachomatis’t. Sümptomaatilistel patsientidel soovitatakse kompleksdiagnostikat - nn suguhaiguste diagnostilised paneelid (Eestis Quattromed HTI), kuhu on koondatud enamlevinud tekitajad: N.gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis,