rasedusnädalal ning lootevett kasutatakse tsütogeneetiliseks uuringuks (loote karüotüübi määramiseks). Protseduuriga seotud raseduse katkemise risk on umbes 0,5%. Amniotsenteesi võib vajadusel kasutada ka hilisemas rasedusjärgus: lootevett võib uurida seal esinevate infektsioonide suhtes, määrata bilirubiini sisaldust lootevees (reesusisoimmunisatsiooni korral), lootevee biokeemilisi uuringuid kasutatakse ka loode kopsude küpsuse hindamisel. Liigveesuse korral kasutatakse vahel leevendusamniotsenteesi - lootevee kogust vähendatakse selle väljaaspireerimisega. Alternatiivne võimalus tsütogeneetiliseks diagnostikaks on koorioni biopsia. See teostatakse tupe- või kõhukatete kaudu raseduse 9.-11.nädalal. Peenikese nõelaga aspireeritakse ultraheli kontrolli all koorioni hattusid, materjal uuritakse tsütogeneetiliselt. Raseduse katkemise risk on pisut suurem kui amniotseteesil. Väga varajases raseduse järgus teostatud koorioni biopsia korral on täheldatud loote