Mikroobifusioloogia
juhuslikult üle kogu maatriksi. See tulenes preparaadi eelnevast töötlemisest, kui
töötlemise ajal rakud tahtmatult tapeti. Sellest johtuvalt hävisid elusate rakkude
biofilmi struktuurid ega osatud vastata küsimusele, kuidas maatriksi
sügavustesse sukeldunud bakterirakkudel on ligipääs toitainetele ja hapnikule.
Alles 1990. aastate alguses, koos uue mikroskopeerimise tehnika tulekuga,
suudeti välja selgitada biofilmi struktuur. Esimesed skanneeriva
lasermikroskoobiga (SCLM) tehtud pildid elusast biofilmist näitasid, et biofilmid on
mikroorganismide kõrgelt organiseeritud struktuurid, mis oma kujult meenutavad
seeni ning mille eksopolüsahhariidsest maatriksis paiknevad rakud on
ümbritsetud avatud veekanalitega. Veekanaleid läbiv vesi varustab biofilmi
sügavamates kihtides paiknevaid rakke toitainete ja hapnikuga ning samas tagab
ka rakkude elutegevuse käigus vabanevate jääkainete eemaldamise. Seega