Bioenergeetika eksam
voolavad tagasi läbi ATP süntaasi. ATP sünteesitakse maatriksis.
Kompleks I oksüdeerib NADH, transportides samal ajal 4H+/2e- , nii nagu selle
sees töötaks veel seniavastamata Q-tsükkel (punktiirjoon). Elektronid kanduvad
ubikinoonile, mis haarab samuti 2H+/2e-. Joonisel on näitamata, et NADH
oksüdeerumisel eraldub selle koosseisust H+, mis vähendab üldise
prootontranspordi suhte Kompleks I juures 6H+/2e-, asemel 5H+/2e- tasemele.
Prootonid pumbatakse mitokondri kristast välja, membraanide vahelisse
ruumi, ning see muutub aluselisemaks. ATP tuleb välja viia ja ADP sisse tuua. Kui
nad üksteise suhtes vahetada, siis välja viiakse rohkem ioone kui sisse tuuakse
ning seega tuleb ka fosfaat selle sissetoomisega ühendatud.
Kompleks II saab elektronid otse suktsinaat-fumaraat reaktsioonist, mis toimub
membraanile ankurdatud Kompleks II juures, mitte vabalt difundeeruva NADH-ga,
nagu Kompleks I juures. Elektronid kanduvad FAD ja kompleksile seotud
annaabi.ee 
