Biosüstemaatika teooria ja meetodid
suuremate andmemaatriksite (taksonite ja tunnuste hulga) jaoks on kaks.
PAUP versioon 3.1.1 on määratud kasutamiseks Apple Macintosh-tüüpi per-
sonaalarvutitel (mida hinna tõttu on Eestis veel suhteliselt vähe). Pro-
grammil on hulk võimalusi kasutada erinevaid meetodeid, kaasa arvatud mole-
kulaarsüstemaatika tunnuseid kasutavad. Versioon 2.4 on määratud kasutami-
seks meil tavalistel IBM PC-tüüpi, matemaatilise koprotsessoriga varustatud
personaalarvutitel, kuid on juba moraalselt vananenud ja palju väiksemate
võimalustega. Selle uus versioon on tulekul, kuid saabumine võib võtta veel
palju aega.
HENNIG86 on määratud kasutamiseks IBM PC tüüpi arvutitele ja ei nõua
koprotsessori olemasolu. Programmi on palju kasutatud Skandinaaviamaades;
piiranguks on väiksem kasutamisvariantide hulk (PAUP 3.1.1-ga võrreldes),
ka eelistatakse PAUP-i seetõttu, et selles kasutatavad algoritmid on vähe-
annaabi.ee 
