Koostu tegemine algusest peale: mida iga bioloog peaks teadma
Seega
peavad tarkvarade loojad pidevalt olema arengutega kursis ja kohastuma nii, et loodavad programmid
suudaksid andmeid õigesti töödelda. Kuna sisendandmed on kiires muutumises, on keeruliseks
osutunud ka seniste koostute kvaliteedi hindamine. Kui genoom saab assembleeritud ehk taas
kokkupandud, mille alusel võivad teadlased väita, et tegemist ongi absoluutselt õige koostuga?
Meetrikud, mille alusel antakse koostutele kvaliteedihinnanguid ei ole sugugi mitte alati üksteist
võimendavad. Esineb lõivsuhe õigsuse (vigade puudumise) ja pikkuse parameetrite vahel. Järgmiseks
oluliseks hetkeks on otsuse langetamine, kumb iseloomustaja on olulisem, kas pikkus või vigade
puudumine?
Koostu tegemine algusest peale ehk de novo assembly
Koostuid on võimalik üles ehitada kahel erineval viisil. Vastavalt sellele, kas on olemas referents-