“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
Kasutades massi märkega ühte neist AH-st, saab
kindla massnihkega peptiide.pSILAC. Pulss märkimisega SILAC. Rakkudele lisatakse
erineva märkega aminohappeid (söötmevahetus). Jälgitakse kahe või enama märkega
peptiidide suhet LQC/MS abil. Võimaldab analüüsida paljude valkude sünteesi
kineetikat samades rakkudes. Näide: hiire fibroplastide kultuur – globaalne
geeniekspressiooni regulatsioon. mRNA ja valkude eluead ning koopiaarvud.
Aminoatsüül-tRNA süntetaasid
Aminoatsüül-tRNA süntetaaside jaotus kahte klassi. aaRS-id jagatakse kahte klassi (I ja II)
ja kummassegi klassi kuulub 10 liiget. Klassidesse jagamise aluseks on konseveerunud ah
järjestused ja iseloomulikud struktuursed motiivid. Erinevused järjestustes annavad
tulemuseks aktiivsaidi erineva 3D struktuuri ja erineva tRNA ja aaRS-i molekulide
stereomeetrilise seondamise. Klassid jaotakse omakorda kolme alamklassi nende homoloogia