Vabadussõja kindralid ja admiralid
saates 1936. aasta sügisel laiali tartu Üliõpilaskonna Edustuse ning asendas selle
riigiametnike määratud Üliõpilaskonna Ajutise Juhatusega. Uus Ülikoolide seadus,
mis anti Jaaksoni poolt välja 1937. aasta septembris, piiras ülikooli autonoomiat ning
seadis üliõpilasorganisatsioonide jms. järelvalve teostajaks üliõpilaskona kuraatori,
kelleks sai Hermann Jaakson.
Et viia valitsuse ideoloogiat koolidesse, katsetati 1937 .aasta suvel sundusliku
laagriga koolijuhatajaile ning 1939. aastal laagrigaõpetajaile. Võib arvata, et
haridusminister kolonel Aleksander Jaakson ei olnud üliõpilaskonnas ja
õpetajaskonnas eriti populaarne.
Jaaksoni jääva väärtusega ettevõtmiseks haridusministrina oli aga Eesti Teaduste
Akadeemia asutamine jaanuaris 1938.
Jüri Uluotsa valitsuse tulekul 12. oktoobrist 1939 jäi Jaakson valitsuse koosseisust
välja ning nimetati samast päevast Sõjavägede Staabiülemaks. 24. veebruaril 1940
ülendati ta kindralmajoriks.