“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
esineb vaid vähestes geenides. Alternatiivsed koodid on peamiselt mitokondrites ja
plastiidides, st väga väikestes genoomides. Pärmi Candida mõnedel liikidel (nt albicans) on
CUG koodon kas kahetähenduslik või vastab seriinile (Leu asemel). Mycoplasma capricolum
kasutab ainult 56 koodonit, st 5 koodonit valgu geenides ei esine.
Selenotsüsteiin ja pürrolüsiin (esinemine, koodonid ja valku lülitumise teed)
Koodonikasutamise indeksid (CAI - codon adaptation index)
Programmeeritud raaminihe (RF2, retroviirused)
Cai – igale koodonile antakse arvuline väärtus vastavalt tema esinemisele sagedastes
valkudes. Kõige kasutatavam koodon saab väärtuse 1, teiste kasutatavus arvutatakse selle
järgi. kõigi alternatiivsete koodonite kasutuse hulgast võetakse geomeetriline keskmine, mis
ongi CAI. Terminatsioonifaktor II (RF II) tunneb ära UGA koodoni. Kui RF II-te on rakus