Molekulaardiagnostika kordamisküsimused
ja referents märgistatud Cy3 ("straight"). Korduskatse kus eksperimentaalne proov
märgitud Cy3 ja referents (kontroll) märgistatud Cy5 ("switch")
-Andmepanga valik: kus ja kuidas säilitada andmeid?
Andmete eeltöötlus ja normaliseerimine:
-Filtreerimine: müra (taustsignaal) kõrvaldamine? Madala intensiivsusega signaalid
(spots)? Küllastunud signaalid? Madala kvaliteediga signaalid (ghosts spots, tolmu spots
etc).
-Ekstreemsed proovid?
-Koduhoidjad (housekeeping) geenid = kontrollgeenid
-Intensiivsusest sõltuv (tavalisene): globaalset intensiivsust või globaalset suhet kasutades
arvutatakse üks normaliseerimifaktor
Mikrokiipidel põhinevad valk-DNA seostumiskohtade uuringud:
-Kaardistamine kasutades kromatiini immunopretsipitatsioonitehnikaid ja kiipe.
-----Valgud ristseotakse (crosslinking) genoomsele DNA-le in vivo.
-----DNA lõigatakse ensüümidega või mehhaniliselt
-----DNA-valk kompleksid immunopretsipiteeritakse
annaabi.ee 
