Mikroobifusioloogia
lehtede kaudu, mida kasutavad bakterid vastavate taimekudede
koloniseerimiseks. Vaatamata sellele vähendab UV-kiirgus, pindade kuivamine ja
toitainete vähesus lehtede ja varte koloniseerimist. Ainult spetsiifilised bakterid
on võimelised taime maapealseid osi koloniseerima ning see toimub õhulõhede
ja hüdratoodide kaudu. Hüdratoodid on taimeorganid, mille kaudu taim
vabaneb üleliigsest veest, kui aurumine on vähene.
Sõltuvalt bakterist on välja pakutud erinevaid koloniseerimisviise, mida
võib jagada kaheks: passiivseks ja aktiivseks koloniseerimiseks. Bakterid peavad
läbima taime eksodermi (koorerakkude kihi), mis on esmaseks barjääriks. Kui
bakter tungib läbi endodermi ning jõuab ksüleemi (taime juhtkoed, millega
transporditakse juurtest peamiselt vett taime maapealsetesse osadesse), saab
bakter liikuda kõikidesse taimeosadesse. Samas liiguvad endofüüdid mööda
juhtkimpe väga aeglaselt ning selle põhjust ei osata seletada. Ksüleemi poorid on
annaabi.ee 
