Molekulaar- ja rakubioloogia
3. Lisasin 0,1g geeli kohta 0,3 ml, ehk 17*0,3 = 0,51ml = 510 µl ADPd (Agarose
Dissolving Buffer), mis lahustab geeli, ning panin inkubeerida 55 C 5 juures geeli täeliku
sulamiseni. Vahepeal nipsutasin tuubi, et kiirustada sulamist.
4. DNA – geeli – puhveri segu pipeteerisin Zymo-SpinTM
kolonni (mis oma korda koosneb kolonnist ja kogumistopsist.
Kolonn sisaldab ränifiltri, läbi mille me laseme oma segu
jooksma. DNA seostub räniiksiidi osakestega, sellega ta ei
saata kogumistopsi, vaid jääb kolonni filtri peale. Kolonni
saagis minu DNA lõigule on vahemikus 70-90%) ja
tsenrifugeerisime 30sek ja viskasin läbivoolatud puhver välja.
5. Lisasin 200µl pesupuhvrit ja jalle fuugisin 30 sek x2 korda,
et olla kindel, DNA on puhas.
6. DNA elueerimiseks kasutasime MQ vett, mille pH oli > 6.0 (teisel juhul, DNA võib
kahjustuda). Panin 10µl MQ vett peale ja fuugisin 1 min jooksul. DNA vabanes
ränioksiidist ja sai kogumistopsiku sisse.
7