7. Selgita populatsiooni diversiteediparameetrit Θ (teeta) ja seda defineerivat valemit! Mis on lihtsaim viis teeta väärtuse hindamiseks DNA järjestuste alusel? Nukleotiidide mitmekesisus populatsioonis θ (teeta) on oodatav keskmine erinevate nukleotiidide arv kahe juhusliku järjestuse vahel. Väärtus antakse kas kogu järjestuse või 1 saidi kohta. Valem : θ = 4Neµ Kui 1 põlvkonna kohta tekib 1µ mutatsiooni (µ on mutatsioonikiirus) ja koalestsentsipuul on keskmine oodatav aeg 2 liini ühinemiseni 2Ne generatsiooni, siis keskmine oodatav mutatsioonide arv 2 järjestuse vahel on 2*2Neµ (sest 2 järjestust = 2 haru puul) Iga koalestsentsi-intervalli (puu harupikkus 2N ühikutes) τ (tau) jooksul on oodatav keskmine mutatsioonide arv 1 liinis 2Neµτ = τθ/2 Teeta väärtust saab hinnata keskmise paaride vahelise erinevuse π (pii) abil. See on kõigi võimalike järjestuste paaride summa jagatud paaride arvuga.
annaabi.ee 
