Populatsioonigeneetika eksam
k liini seas leiavad 2 liini ühise esivanema (1 koalestsents = liinide arv
väheneb 1 võrra) keskmiselt aja t(i) jooksul:
Generatsioonides t(i) = 2*2N/(k*(k-1))
2N ühikutes t(i) = 2N/(k*(k-1))
Keskmine TMRCA ehk puu sügavus:
Generatsioonides:
2N ühikutes: TMRCA = 2*(1-1/k)
Kui koalestsentsi tõenäosus igas põlvkonnas on 1/2N, siis keskmiselt tuleb
oodata 2N põlvkonda kuni 2 liini koalestseeruvad. Koalestsentsiaegade
standardhälve on samuti 2N põlvkonda. Koalestseerumise aeg on ennustatav
suurte veapiiridega. Jaotuse hajuvus on suur. Koalestsentsiajad jaotuvad
eksponentjaotuse/geomeetrilise jaotuse järgi (ja sellepärast ongi suur
hajuvus). Ehk mida sügavamale seda suurem hajuvus.
5. Kirjelda liinide koalestseerumist populatsiooni kasvamise/kahanemise
korral! Kuidas see mõjutab genealoogia puu kuju?
Koalestseerumised jagunevad selliselt, et esmalt toimub lühikese ajajooksul