Populatsioonigeneetika eksam
Iga koalestsentsi-intervalli (puu harupikkus 2N ühikutes) τ (tau) jooksul on
oodatav keskmine mutatsioonide arv 1 liinis
2Neµτ = τθ/2
Teeta väärtust saab hinnata keskmise paaride vahelise erinevuse π (pii) abil.
See on kõigi võimalike järjestuste paaride summa jagatud paaride arvuga.
Eeldusel, et kehtib lõputute saitide mudel
8. Selgita lühidalt, mis on “skyline” mudel populatsiooni efektiivse
suuruse hindamiseks.
Skyline koalesentsmudeli korral lävendist lühemad intervallid liidetakse
naabriga.
Effektiivse populationi suuruse arvutamiseks kasutatakse valemit:
Ne = uk(k-1)/2
Ne - pop.suurus ajal u ; u - aja u pikkus; k - liinide arv ajal u
9. Mis on populatsiooni efektiivne suurus Ne? Nimeta mõned Ne
alaliigid.
Ne on indiviidide arv Wright-Fisheri ideaalpopulatsioonis, millel puhul on
geenitriiv sama kiirusega, kui vaadeldavas reaalses populatsioonis. Vahel