Populatsioonigeneetika eksam
mudeli parameetrite hindamise meetodid. Tihti baseeruvad
koalesentsiteoorial. Simuleeritakse mudeli alusel andmed ja võrreldakse
parametri hinnanguid simuleeritud ja reaalsete andmete vahel.
2. Kirjelda kuidas saab simulatsioone kasutades hinnata empiirilise
populatsiooni sisese geneetilise varieeruvuse (π – keskmine
paariviisiline erinevus) hinnangu usalduspiire.
DNA järjestustest leitakse keskmine paariviisiline erinevuste arv π. Lähtuvalt
koalesentsiteooriast simuleeritakse suur hulk koalesentsi puid eeldades
lõputute saitide mudelit. Kasutades sedasama leitud π, paigutatakse puudele
juhuslikult mutatsioonid (π/2 igale liinile – juurest tipuni). Nüüd on võimalik
nende puude pealt tuletada DNA järjestused ja iga simulatsiooni kohta
arvutada π. Nii same π hinnangute jaotuse millelt saame hinnata näiteks 95%
usalduspiire.
3. Mida saab välja lugeda populatsiooni sisese paariviisiliste
erinevuste jaotusest
annaabi.ee 
