“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
Erinevused järjestustes annavad
tulemuseks aktiivsaidi erineva 3D struktuuri ja erineva tRNA ja aaRS-i molekulide
stereomeetrilise seondamise. Klassid jaotakse omakorda kolme alamklassi nende homoloogia
ja domäänide struktuuri alusel. Klass I süntetaaside katalüütiline sait sisaldab Rossmanni
volti (beeta-paralleelne kiht). Seal leidub kaks konserveerunud järjestusmotiivi-
HIGH(esimene alfaheeliks) ja KMSKS(kujutab endast lingu, mille konformatsiooni muutus
substraadi seondamisel aitab aktiveerida ah-t. Klass II aaRS aktiivtsenter on suurem, koosnev
antiparalleelsest beeta-kihtidest, mis on ümbritsetus alfa-heeliksitega. Aktiivtsentris
eristatakse kol motiivi: ATP sidumiseks, ah sidumiseks ja dimerisatsiooniks. Klass I : on
mono- või dimeerid, ATP konformatsioon on venitatud, aminoatsüleerimissait: tRNA
terminaalse adenosiin 2´-OH