Vajad kellegagi rääkida?
Küsi julgelt abi LasteAbi
Logi sisse
Sulge

"klasterdamismeetodeid" - 1 õppematerjal

klasterdamismeetodeid on rohkelt, neist levinumad on lähimnaabri meetod (simple-linkage clustering), aritmeetilisi keskmisi kasutav kaalumata paa- ride meetod (UPGMA - unweighted pair-group method using averages) ja täis-
Biosüstemaatika teooria ja meetodid
76
pdf

Biosüstemaatika teooria ja meetodid

[Meenutagem, et graaf on punktide hulk, milles vähemalt osa punkte on ühendatud joontega.] Sel- leks on mitu võimalust, mida võime realiseerida ordinatsioonimeetodeid või klasteranalüüsi kasutades. Allpool vaatleme klasteranalüüsi teostamist. 7.2.1. Enim kasutatud vorm on klasteranalüüs, mille tulemuseks on haru- nev, sarnasust kujutav fenogramm. Sarnased OTUd on selles ühendatud hierar- hiliselt harunenud ühise "juurega" puu harudeks, kobaraiks, klastreiks. Klasterdamismeetodeid on rohkelt, neist levinumad on lähimnaabri meetod (simple-linkage clustering), aritmeetilisi keskmisi kasutav kaalumata paa- ride meetod (UPGMA - unweighted pair-group method using averages) ja täis- sideme-klasterdus (complete-linkage clustering). 7.2.1.1. Lähimnaabri meetodi puhul leitakse kaks OTUt, mille erinevus on minimaalne, ja ühendatakse need arvestades OTUDe distantsi teineteisest (joon. 2). Edasi arvutatakse distants selle klastri ja ülejäänud OTUde va-

Bioloogia → Bioloogia
6 allalaadimist


Sellel veebilehel kasutatakse küpsiseid. Kasutamist jätkates nõustute küpsiste ja veebilehe üldtingimustega Nõustun