"kaugmaatriksite" - 1 õppematerjal

Bioinformaatika arvestus ül

00986 0.00253 1 ece_Z0213 0.01078 0.00092 1 eco_b0201 0.01078 0.00092 d. Analüüsida tulemusi ning võrrelda omavahel lähtudes programmide algoritmidest (juhend!). Vastus: Samade meetoditega tulid puud suhteliselt sarnased, kuid eri meetodeid kasutades tulid ka suhteliselt erinevad puud. Näiteks DNADIST, FITCH, KITSCH ja NEIGHBOR võrdlesid järjestusi kaugmaatriksite põhjal. DNAML ja DNAMLK arvestasid iga elemendi asenduse tõenäosusega ning leidsid kõik võimalikud puud. Distance methods These programs are intended to be used sequentially. First a distance matrix is calculated by dnadist or protdist program from the multiple sequence alignment. The matrix is then  Kristina Raud