1) Topoisomeraas I tüüpi ensüümid viivad DNA molekuli üksikahelalise katke ja kõrvaldavad ühe superspiraali. Nad konserveerivad energia, mis vabaneb fosfodiestersideme lõikamisest ning kasutavad seda hiljem sideme taastamiseks. Sellesse klassi kuuluvad ensüümid võivad kõrvaldada nii positiivseid kui ka negatiivseid supersiraale. E. coli topoisomeraas I (geeni topA produkt) kõrvaldab ühe katkega ühe negatiivse superspiraali. 2) Topoisomeraas II tüüpi ensüümid viivad DNA molekuli ajutiselt kaksikahelalise katke ja lisavad või kõrvaldavad ühe ataki käigus ATP energiat kasutades 2 superspiraali. Nad jäävad DNA otstega kovalentselt seotuks ning hiljem taastavad fosfodiestersidemed. Kõige paremini on uuritud E. coli ensüümi DNA güraas, mis on tetrameerne valk (koosneb kahest subühikust
- lagundamine või lihtsalt ahela vahetus - kaks või üks Holliday koht - mõlemad liiguvad edasi - katkestused – vastupidi, et kumba peab lõikama, et tekiks rekombinatsiooni produkt. RecBCD aitab võõrast DNA-d lagundada, taastada replikatsioonikahvel ja korraldada rekombinatsiooni. RuvA kõigi nelja DNA ahelaga sidumiseks oma piirkonnad olemas. Need piirkonnad on omavahelises orientatsioonis nii, et ühendus saab vabalt liikuda. Rekombinatsioon algab kaheahelalise katkega - Ruv A, Ruv B on b ensüümid. - 3 ensüümi ReBCD moodustavad DNA-l kompleksi ja, lagundavad kaheahelalisel DNA-l ühe ahela ära. - D;BC – üks on helikaas, ahel on katki, teine on nukleaas, mis lagundab. - X- sait – lambda järjestus – sellel kohal on krossingover väga sage. See jääb tekkiva üheahelalise DNA 3’ otsa. - seondub RecA – tekitab DNA-s RecA filamendi, katalüüsib ahela vahetust, algselt tekib kolmeahelaline DNA
1) Topoisomeraas I tüüpi ensüümid viivad DNA molekuli üksikahelalise katke ja kõrvaldavad ühe superspiraali. Nad konserveerivad energia, mis vabaneb fosfodiestersideme lõikamisest ning kasutavad seda hiljem sideme taastamiseks. Sellesse klassi kuuluvad ensüümid võivad kõrvaldada nii positiivseid kui ka negatiivseid supersiraale. E. coli topoisomeraas I (geeni topA produkt) kõrvaldab ühe katkega ühe negatiivse superspiraali. 2) Topoisomeraas II tüüpi ensüümid viivad DNA molekuli ajutiselt kaksikahelalise katke ja lisavad või kõrvaldavad ühe ataki käigus ATP energiat kasutades 2 superspiraali. Nad jäävad DNA otstega kovalentselt seotuks ning hiljem taastavad fosfodiestersidemed. Kõige paremini on uuritud E. coli ensüümi DNA güraas, mis on tetrameerne valk (koosneb kahest subühikust GyrA ja GyrB)