Bioinformaatika arvestus ül
060290
2. DNA järjestuste fülogeneetiliste puude arvutamine kasutades erinevaid
fülogeneetiliste puude koostamise programme.
a. Leida geeni rrsH (KEGG, iseloomustada lühidalt) järjestused järgmistele
organismidele:
Vastus:
1. Escherichia coli K12 MG1655
http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?eco:b0201
>eco:b0201 rrsH; 16S ribosomal RNA; K01977 16S ribosomal RNA (N)
aaattgaagagtttgatcatggctcagattgaacgctggcggcaggcctaacacatgcaa
gtcgaacggtaacaggaagaagcttgcttctttgctgacgagtggcggacgggtgagtaa
tgtctgggaaactgcctgatggagggggataactactggaaacggtagctaataccgcat
aacgtcgcaagaccaaagagggggaccttcgggcctcttgccatcggatgtgcccagatg
ggattagctagtaggtggggtaacggctcacctaggcgacgatccctagctggtctgaga
ggatgaccagccacactggaactgagacacggtccagactcctacgggaggcagcagtgg
ggaatattgcacaatgggcgcaagcctgatgcagccatgccgcgtgtatgaagaaggcct