“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
Märgitakse nt metaboolselt. Raskete ja
kergete ahelate suhe, leiame keskmise. Leiame valgu suhte nendes kahes proovis. Sarnast
märkimist võib teha kasutades AH keemilisi omadusi (aminorühm, millel eriline reaktsioon
mingi kindla ainega, mida teistel AH pole). Ensümaatiline märkimine (karboksüterminaalse
AH märkimine mingi kemikaaliga).
SILAC märkimine, pSILAC valgusünteesi dünaamikma uurimisel. SILAC Valgud
märgitakse stabiilsete isotoobidega. Rakukultuuris märgitakse valgud lisades söötmele
raskeid aminohappeid. Harilikult lüsiin, arginiin või leutsiin, mis sisaldavad 2H, 13C
15
või N aatomeid. Valgud lõigatakse peptiidideks ja peptiidid eraldatakse
kromatograafiliselt. Kindla väärtusega m/z ioonide kvantitatiivne suhe näitab
peptiidide ja seega ka valkude suhet. Trüpsiin lõikab valguahelat positiivselt laetud
annaabi.ee 
