X1: 16 (7.4 bits) X2: 38 (14.6 bits) X3: 64 (24.7 bits) S1: 41 (20.4 bits) S2: 79 (35.0 bits) b. Uurida leitud oletatavaid konserveerunud domeene, millistes vahemikes asetsevad? Mis piirkond on märgitud umbes 500 aminohappe juures? Millised on tõenäoliselt uuritavad valgud ja miks? VASTUS: Konserveerunud domeenid 500 aminohape juures on valgu piirkond mis, ei sarnane mitte ühtegi valguga. Uuritavad valgud on TIM, Triosephosphate isomerase, CDP-diacylglycerol pyrophosphatase, TpiA, Triosephosphate isomerase, selle pärast, et nendel on kõige suurem skoor. c. Kirjeldada lühidalt leitud valkude funktsioone (NCBI lingid, võib otsida infot ka teistest andmebaasidest), milline neist on seotud glükolüüsiga? VASTUS: Leitud valkude kirjeldused (lingid): pfam00121, TIM, Triosephosphate isomerase http://www.sanger.ac.uk/cgi-bin/Pfam/getacc?PF00121
kandunud Tavaliselt antibiootilist resistentsust tagavad geenid Ka herbitsiidi resistentsuse geen on hea marker Rakud pannakse kasvama antibiootikumi või herbitsiidi sisaldavasse meediumisse ja need mis jäävad ellu, on tõenäoliselt edukalt transformeeritud. Antibiootikumi resistentsust tagavate geenide puhul eelistatakse neid, mis ei ole meditsiinis kasutusel. Uus suund: taime ainevahetuse markergeenide suunas (phosphomannose isomerase, xylose isomerase etc) (loeng 7) Reporter geen - Paigutatakse huvi all oleva geeni lähedale Et oleks lihtne identifitseerida transformeerunud rakke Et saaks hinnata ekspressiooni Näiteks: beta glucuronidase gene (gusA gene) toodab sinist molekuli (transformeerunud rakud on sinised) Roheline fluorestseeruv valk (green fluorecent protein - gfp) rakud helendavad rohelise valguse käes Lutsiferaas (luciferase) jaanimardikast rakud helenduvad pimedas
nisms that control postmortem proteolysis changes in porcine longissimus muscle and aging tenderization have not changed between 0 and 72 hours postmortem substantially over the last decade, techno- (Lametsch et al. 2003; Morzel et al. 2004). 98 Chapter 4 From these studies, myofibrillar proteins or chain fragments, myosin light chain II, and fragments of myofibrillar proteins found to triose phosphate isomerase at 72 hours post- change with postmortem storage include mortem correlate to shear force measure- actin, myosin heavy chain, titin, myosin ments at 1 and 4 days postmortem in porcine light chain I, myosin light chain II, CapZ, longissimus muscle (Lametsch et al. 2003). cofilin, troponin-T, cypher proteins, and Similarly, spots corresponding to actin, myo- myozenin. Sarcoplasmic proteins enolase, kinase, F-actin capping protein, HSP27,
annaabi.ee 
