Geenitehnoloogia (GMO)
kloonimisse efektiivsus keskmiselt 1:50 st.
ühel juhul siseneb insert vektorisse ja 49-l
juhul toimub lihtne vektori retsirkulariseerumine.
Vektori retsirkularisatsiooni vältimiseks /
vähendamiseks ja kloonimise efektiivsuse
tõstmiseks on mitmeid võimalusi.
1. Kasutada vektori lineariseerimiseks
restriktaase, mis annavad erinevaid
üheahelalisi otsi. Taoliselt on võimalik
defineerida ka inserdi sisestamise suunda.
2. Vektorit töödeldakse aluselise fosfataasiga,
Näit. CIP (calf intestin phosphatase). Selle
tulemusel eemaldatakse vektori 5'fosfaat
rühmad ja vektor ei religeeru iseendaga kokku.
3. Tömpide otstega DNA lõikude paremaks
sisestamiseks kasutatakse ka linkereid või
adaptereid. Linkerid ja adapterid on kaheahelalised
sünteetilised oligod, mis sisaldavad
restriktaaside poolt äratuntavaid DNA
järjestusi (restriktsiooni saite)
Esimeses ringis ligeeritakse adapterid või
linkerid, mida võetakse DNA fragmentide
suhtes suures ülehulgas, et ligeerimisel