“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
Mõned klass I
süntetaasid vajavad ah aktivatsiooniks tRNA juuresolekut, mis muudab ensüümi
konformatsiooni nii, et suureneb süntetaasi afiinsus ah suhtes. Ah karboksüülrühma hapnik
reageerib ATP alfa-fosfaadiga. Mg on aaRS-dele kofaktoriks, aidates muuhulgas stabiliseerida
ATP konformatsiooni. Süntetaasi pinnal moodustub aminoatsüüladenülaat, mis kujutab endast
aminohappest ja ATP-st koosnevat aktiveeritud intermediaati. Reaktsiooni käigus vabaneb
4
pürofosfaat. (2) aaRS:aa:AMP + tRNA = aaRS + aa-tRNA + AMP. tRNA seondamine toimub
tänu spetsiifiliste interaktsioonide süntetaasi ah ja tRNA nukleotiidide vahel. Teises etapis
toimub tRNA 3´-terminaalse adenosiini 2´või 3´ süsiniku küljes oleva karboksüülrühma
nukleofiilne atakk aminoatsüül-adenülaadi karboksüülrühmale
annaabi.ee 
