"interaktsioonikaardid" - 1 õppematerjal

Genoomi struktuur ja funktsioon

elementide kogumi vahel. Ehk võimaldab analüüsida interaktsioone mitme valitud lookuse vahel. Hi-C – all by all analüüs Andmete interpreteerimine – 3C ja 4C annab lineaarsed profiilid piki kromosoomi. 3C meetod annab andmeid lookuste lähedal paiknemise kohta, kuid ei erista funktsionaalseid mittefunktsionaalsetest. 3D andmed esindavad suuremat interaktsioonide summat üle raku populatsiooni. 5C ja HiC interaktsioonikaardid – mida tumedam värv, seda tugevam interaktsioon. 8  Eelised  Võimaldab detekteerida genoomseid interaktsioone.  Need interaktsioonid võivad paljastada geeniekspressiooni regulatsiooni detaile.  5C võimaldab konstrueerida komplekseid interaktsioone spetsiifilistes lookustes. Miinused  Produkti detekteerimine ei tähenda alati, et on toimunud spetsiifiline