Mikroobifusioloogia
elemendi täpset positsioneerimist. Kui elementide vahel on liiga palju nukleotiide
või liiga vähe, siis promootori elemendid pöörduvad DNA-l sigma faktorist mööda
ning transkriptsiooni initseerimine on vähendatud. Negatiivse
superspiralisatsiooni korral, kui DNA on lõdvem, on sigma faktoriga kohakuti
need promootorid, mille elementide vaheala on lühem kui optimaalne (17
nukleotiidid). Selliste promootorite korral kaob DNA superspiralisatsioonist
sõltuvus, kui vahealasse inserteerida nukleotiid juurde (nt tRNA tyrT promootor).
2. Avatud kompleksi moodustumine. Sellisel juhul sõltub -10 elemendi
nukleotiidsest koostisest, kas avatud kompleks tekib kergemini või halvemini. -10
element on oma olemuselt AT-rikas DNA piirkond, mis sulab kergemini lahti kui
GC-rikas piirkond. Kui -10 element pole optimaalse järjestusega, vaid on
toimunud asendusmutatsioonid G või C-ga, siis avatud kompleksi moodustumine
on raskendatud ning sellised promootorid on DNA superspiralisatsioonist
annaabi.ee 
