Molekulaarbioloogia praktikumi protokoll
2.1) Võrdle antud transformatsiooni protokolli (mis on kasutusel GTI Molekulaarbioloogia
laboratooriumis) DNA kokaraamatus tooduga. Millised on erinevused?
Meie inkubeerime 5min 37 kraadi juures, kokaraamatus 1,5min 42 kraadiga.
2.2) Millisel juhul võib bakterikoloonia sisaldada rekombinantset plasmiid, kuid samas koloonia värvus
on ikka sinine. Kuidas määrata, et selles koloonias on rekombinantne plasmiid?
Avatud lugemisraam, stop-koodon puudub või kui initsiatsioon algab meie inserdist. Määrata saab
restriktsiooniga, kui multikloneerimissaidis on restriktaas SacII.
2.3) Mis juhtub, kui jätta Amp panemata?
Võivad hakata kasvama muud bakterikolooniad, mitte plasmiidi sisaldavad bakterid. Meile olulised
plasmiidi sisaldavad bakterid on Amp'ile resistentsed ning suudavad selles keskkonas kasvada.
6
2.4) Rakkude kompetentsus on nende võime vastu võtta DNA-d/plasmiidi