Molekulaarbioloogia
DNA otste lahtisulamine → avatud kompleksi moodustamine, tunduvalt aeglasem,
kui esimene protsess (miljard x)
esimese 10 nukleotiidi süntees → suhteliselt kiire
üleminek initsiatsioonilt elongatsioonile → kõige aeglasem + edasiste nukleotiidide
süntees. Promootori puhastamine. Pooltel juhtudel jääb süntees pooleli. Sõltub ATP
(GTP) kontsentratsioonist. Esineb ka analoogseid ensüüme, mis pärsivad
edasiminekut. Elongatsioon, kui on lahti läinud, toimub kiiresti. F
Initsiaatoris võib mitu RNA polümeraasi seonduda ja kui promootor on vabastatud, siis
võib mitu korda ühelt geenilt.
RNA polümeraas – DNA sõltuv nukleotidüültransferaas, sünteesib fosfodiestersidet.
RNA sünteesi keemia – RNA 3’ otsa seostub ATP või ekvivalent oma 5’ otsaga ning
vabaneb pürofosfaat (pöördumatu reaktsioon, kuna pürofosfaadi lõhkumine kulutab
energiat).
Oluline on tekkiva kaksikahela geomeetria, kui see on vale, eemaldatakse vana
nukleotiid ja uus pannakse asemele.