"initseerimist" - 1 õppematerjal

Viroloogia

Seega on replikatsiooni initseerimiseks oluline pigem RNA ruumiline struktuur. Kuna replikatsioon initseeritakse G-jäägi liitumisega siis arvatakse, et selleks on oluline EF- Tu. Replikatsiooni käik  RdRp sünteesi kiiruseks on umbes 35 b/sekundis.  Replikatsiooni esimeseks etapiks on vaba negatiivse polaarusega RNA süntees, dsRNA-d ei teki. Tavaliselt toimub ühelt positiivselt RNA ahelalt mitu järjestikust negatiivse ahela sünteesi initseerimist. Süntees lõpeb ühe täiendava A-jäägi lisamisega minus ahela otsa. Kuna pluss ahel algab G- jääkidega (pppGpGpGp…) siis on negatiivse ahela 3’ otsas järjestus CCCAoh.  Positiivse polaarsusega RNA de süntees erineb negatiivse polaarsusega RNA sünteesist, on lihtsam ja efektiivsem ning sõltub RNA 5’- ja 3’-otstes asuvatest struktuursetest elementidest. Ka siin lisab RdRp maatritsi 3’ otsa