Mikroobifusioloogia
Pseudomonas ja Bacillus, kuid ka teistest perekondadest liigid võivad taimedes
ISR esile kutsuda. Taimedele kasulikud bakterid kutsuvad kolonisatsiooni alguses
sarnaselt patogeenidega ISR-i esile, kuid on võimelised ISR-i vältima ning
koloniseerimise edukalt lõpetama. Tavaliselt kutsub ISR-i esile: flagella,
antibiootikumid, HSL, salitsüülhape, jasmoonhape, siderofoorid ja
lipopolüsahhariidid. Näiteks varre endofüüt Methylobacterium sp. tüvi IMBG290
on võimeline hulgast sõltuvalt muutma kartuli resistentseks patogeenile
Pectobacterium atrosepticum. Sõltuvalt taime endofüütide komplektist võib taim
olla kaitstud patogeensete bakterite vastu või mitte, olenevalt sellest kui
efektiivselt endofüüdid ISR-i esile kutsuvad.
Endofüütsed bakterid võivad taimi kaitsta antimikroobsete ainete
tootmisega. Näiteks Enterobacter sp tüvi 638 toodab antibiootilisi aineid, mille
hulgas on 2-fenüületanool ja 4-hüdroksübensoaat
annaabi.ee 
