Viirused
Raku stimulatsioon vastusena teistele infektsioonidele,
tsütokiinide või mitogeenide toimel toodab transkriptsioonifaktoreid, mis seostuvad LTRiga, võivad viiruse transkriptsiooni
aktiveerida. Kui viirus kodeerib viiruse onkogeene, võib ta promoda rakukasvu, stimuleerida transkriptsiooni ja seega viiruse
replikatsiooni. Raku võime retroviirusgenoomi transkribeerida on koetropismi ja peremeeste spektri teine peamine determinant.
HTLV ja HIV on komplekssed retroviirused. HTLV1 kodeerib viiruse replikatsiooni reguleerivaid tax ja rex valke, mis, erinevalt
teistest, vajavad rohkem kui üht splaissinguetappi. rex kodeerib kaht valku, mis seostuvad viiruse mRNAga ja takistavad edasist
splaissingut, põhjustavad transpordi tsütoplasmasse. Infektsiooni hilistes faasides võimendab rex selektiivselt teatud
struktuurgeenide ekspressiooni, mida rohkem vajatakse. Tax on transkriptsioooni aktivaator, võimendab viiruse genoomi
transkriptsiooni