"hotspotides" - 1 õppematerjal

Genoomi struktuur ja funktsioon

Samuti palindroomsed järjestused, mis soodustavad sekundaarstruktuuride moodustamist stimuleerivad DSB teket – loop osa on tundlik endonukleaasidele ja seega toimub selles piirkonnas kromatiini lõikamine millele järgneb rekombinatsiooniline aktiivsus. • Alternatiivsed rekominatsiooni hotspotide mudelid imetajates: • Cis elementide mudel – hiirtes NID1 hotspotis CCCCACCCC põhjustab rekombinatsiooni. Inimestes CCTCCCT on rikastatud hotspotides. • Trans elementide mudel – hotspot aktiivsus on reguleeritud PRDM9 poolt • DNA omaduste mudel – hotspoti aktiivsus peegeldub selle DNA- sidumise omaduses. • Sekundaarstruktuuri mudel – palindroomsed järjestused indutseerivad DSB-sid – vt üles. • • Rekombinatsiooni ‘hotspot-id’: ulatus, piirid, jaotuvus genoomis ja indiviiditi, nende kaardistamise metoodilised võimalused (otsesed ja