"hotspotide" - 1 õppematerjal

Genoomi struktuur ja funktsioon

toimumist tõstab kõrgem GC sisaldus, kõrgem Alu elementide ja geeni sisaldus. χ-motiiv stimuleerib rekombinatsioonilist aktiivsest. Samuti palindroomsed järjestused, mis soodustavad sekundaarstruktuuride moodustamist stimuleerivad DSB teket – loop osa on tundlik endonukleaasidele ja seega toimub selles piirkonnas kromatiini lõikamine millele järgneb rekombinatsiooniline aktiivsus. • Alternatiivsed rekominatsiooni hotspotide mudelid imetajates: • Cis elementide mudel – hiirtes NID1 hotspotis CCCCACCCC põhjustab rekombinatsiooni. Inimestes CCTCCCT on rikastatud hotspotides. • Trans elementide mudel – hotspot aktiivsus on reguleeritud PRDM9 poolt • DNA omaduste mudel – hotspoti aktiivsus peegeldub selle DNA- sidumise omaduses. • Sekundaarstruktuuri mudel – palindroomsed järjestused indutseerivad DSB-sid – vt üles. •