Molekulaarne evolutsioon
Iga sisesõlm ei pruugi vastata hüpoteetilisele
eellasele.
Juuritud fülogeneesivõrgul esineb erinevalt split
networkist juur.
50. Kuidas konstrueeritakse taandatud mediaanvõrk
(reduced median network) (eeltöötlus, võrgu
konstrueerimine, võrgu taandamine)?
Mediaanvõrgu taandamisel saadud võrk, kus on ebatõenäolised
rajad kustutatud. Mediaanvõrgu lihtsustamisel asendatakse
eeldatavad homoplaassed tunnused kahe eraldi tunnusega.
Saadakse suurem andmemaatriks, mis sisaldab vähem
homoplaasiaid. Tunnuse jagamisel võetakse arvesse tunnustele
omistatud kaalud ja füogeneesiraja valimisel vastavate haplotüüpide
sagedused populatsioonis.
1. Eeltöötlus – andmed viiakse binaarsele kujule, st igat
varieeruvat nukleotiidipositsiooni vaadeldakse splitina.
(Mittevarieeruvad nukleotiidipositsioonid kustutatakse.