"homoplaasiad" - 1 õppematerjal

Molekulaarne evolutsioon

eellasjärjestuse vahetuid järglasi. Leitakse ühisosa – kui tunnuse seisund hulkades a ja b on sama, siis on see ka nende ühisel eellasel, kui erinev siis on nende ühisel eellasel nende hulkade ühisosa. Farrise optimeerimine – iga sõlm saab tunnuse seisundi, mis on antud sõlme ja selle eellase ühisosa. 36. Millised on säästumeetodi eksimused? Mis on vigade põhjuseks? Pika haru probleem – homoplaasiad eksitavad säästumeetodit. Võib esineda juhul, kui evolutsiooni kiirus varieerub liiniti. Kui vale puu on säästlikum kui tegelik puu, siis säästumeetod eelistab valet puud, kuna seal on vähem asendusi. 37. Selgitage tõepära meetodite põhimõtet.  Alustuseks arvutatakse tõepära ühele nukleotiidipositsioonile. Arvutatakse tõenäosus näha tippudes teatud nukleotiide. Mõni neist võimalustest võib olla vähem täenäoline kui teised, kuid mitte ühegi