Ensümoloogia alused. Kordamisküsimused
Inkubeeritakse
ensüümi reagendiga. Määratakse kindlaks, milline aminohappejääk
modifitseerus. Substraat peab pidurdama inhibeerimise kiirust!
· Mutatsioonid punktmutatsioon, on kaasaegne meetod ensüümi aktiivtsentri ja
reaktsioonimehhanismi uurimiseks. Eelistada tuleb konservatiivseid asendusi
Glu, Asp - Gln, Asn; Ser - Ala jne..
Näide: Asp102 rolli seriinproteaasides eeldati tema läheduse tõttu His57le. W.
Rutter valmistas trüpsiini, kus Asp102 oli asendatud asparagiiniga - mutandi
aktiivsus oli 10 000 korda madalam kui natiivsel ensüümil. Mis juhtub kui
muteerida kogu katalüütiline triaad? "Jääkensüüm" ilmutab ikkagi mõningast
katalüüsivõimet - sidumisvõime ja aktiveeritud olekut solvateerivad rühmad jäid ju
alles.
· keskkonnaefektid,
· substraadi struktuuri mõju,
· inhibiitoranalüüs