Erinevate restriktaaside hüdrolüüsi tulemusena tekkivad molekulide otsad võivad olla erinevate "etteulatuvate" ahelatega Restriktaasid on endo(I) tüüpi nukleaasid DNA fragmentide katalüütiline HaeIII 5´...GGCC... 3´ fragmenteerimine leiab laialdaselt 3´...CCGG... 5´ rakendust DNA analüüsil baseeruv HinfI 5´...GANTC...3´ identifitseerimine 3´...CTNAG...5´ EcoRI 5´...GAATTC...3´ 3´...CTTAAG...5´ KpnI 5´...GGTACC...3´ 3´...CCATGG...5´ FokI 5´...GGATG(N)9...3´ 3´...CCTAC(N) ...5´ Nukleoproteiidsed kompleksid supramolekulaarsed valkude ja nukleiinhappe kompleksid Viirused Kromosoomid
BshTI a|ccggt 662 Bsp1407I t|gtaca 168 Bsp19I c|catgg none BspDI at|cgat 980 BspEI t|ccgga none BsrGI t|gtaca 168 BssHII g|cgcgc none BstUI cg|cg 114, 361, 482, 933 ClaI at|cgat 980 DraI ttt|aaa none EagI c|ggccg none EcoRI g|aattc none EcoRV gat|atc 200, 703 EgeI ggc|gcc none FseI ggccgg|cc none FspI tgc|gca 15, 372, 567 HaeIII gg|cc 599 HincII gty|rac 220, 333 HindIII a|agctt none HinfI g|antc 521, 952 HpaI gtt|aac none HpaII c|cgg 93, 177, 215, 243, 663, 867 KasI g|gcgcc none KpnI ggtac|c none MboI |gatc 303, 436, 769, 808 MfeI c|aattg none MluI a|cgcgt none MscI tgg|cca none MseI t|taa 399, 621, 750, 1005 MspI c|cgg 93, 177, 215, 243, 663, 867 NaeI gcc|ggc none NarI gg|cgcc none NcoI c|catgg none NdeI ca|tatg none NdeII |gatc 303, 436, 769, 808