"heksameeridest" - 1 õppematerjal

Mikroobifusioloogia

VirB4 ­ konjugatsiooniaparaadi levinud ATPaas, seda on konserveerunud nii G(-) kui ka G(+) bakteritel. VirB4 on sisemembraanivalk, mis interakteerub VirB3, 6, 7 ja 8-ga. C-terminaalne domeen on tugevalt konserveerunud, ATPaasne aktiivsus. Eraldiseisvana dimeriseerub, kuid on leitud ka monomeere, trimeere ja heksameere. VirB11 ­ AAA+ perekonna heksameerne liikuv ATPaas, mis on T4SS moodustumiseks ja konjugatsiooni toimumiseks asendamatu. Seotud sisemembraaniga, moodustab heksameeridest ringja struktuuri, seondub nii VirB4 kui ka VirD4-ga. Seondudes VirB4-ga initseerib piili biogeneesi, seondudes VirD4-ga sunnib T4SS-i seonduma translokeeritava substraadiga. VirD4 ­ suur sisemembraaniga seotud valk, millel on kaks domeeni: N- terminuse domeen on väiksem ning tagab membraaniga seondumise, seevastu C-terminuses asuv domeen on suur ning tsütoplasmaatiline. Heksameerne. C- terminuses on ssDNA-sõltuv ATPaasne domeen. VirD4 ATPaasseks aktiivsuseks on