Valkude ruumiline struktuur
sekundaarstruktuurid
2 olulist regulaarset sekundaarstruktuuri, kus vesiniksidemed
peaahela elementide vahel stabiliseerivad molekuli on:
1. heeliks
2. struktuur
heeliks: 1951 Paulig
· Ainuke heeliks, mis vastab piiranguteta
Ramachandrani kaardile ja millel on energeetiliselt
kasulikud regulaarsed H sidemed
· 3.6 aminohapet tiiru peale heeliksi tõus 1,5Å
· Keskmine heeliski pikkus 12 aminohappe jääki, 18Å
· Peptiidrühma karbonüül moodustab H sideme n+4
peptiirühma NH rühmaga, iga amiidi vesinik ja karbonüüli
hapnik moodustavad sideme
· Heeliksi sisemuses aatomid tihedalt pakitud
· Mitu heeliksit võivad valgus omakorda kokku keerdunud
olla
heeliks on paremakäeline heeliks
Regulaarsete (korduvate) ja väärtustega
sekundaarstruktuurid II
struktuur: Paulig ja Corey 1951 volditud leht