Molekulaarne evolutsioon
fossiil, enamasti kaudne teadmine lahknemisest. Lahknemise
aeg ja mutatsioonide arv harudel on teada.
Sugupuu abil: väiksete olendite või rakukultuuride puhul on
sarnane meetod mutatsiooni koguv liin.
62. Kirjeldage fülogeneesipuu harupikkusi molekulaarse
kella kohasel puul ja ilma kellata puul.
Kellaga harupikkustel on piirang, ultrameetriline. Ilma kellata on
harupikkused piiramata.
BEAST
63. Nimetage 3 asja, mida saab teha mudelipõhise
fülogeneetilise analüüsiga, aga ei saa teha ilma mudelita.
Mudelipõhisteks meetoditeks on suurima tõepära meetod ja Bayesi
meetod. Mudelid on vajalikud, et kompenseerida mutatsioonilist
küllastumist, et kaasata eelteadmisi evolutsiooni/puu kohta.
mudelisse saab kaasata peale kitsalt evolutsioonipuu omade ka teisi
parameetreid.
64