Populatsioonigeneetika eksam
erinevate nukleotiidide arv kahe juhusliku järjestuse vahel. Väärtus antakse
kas kogu järjestuse või 1 saidi kohta.
Valem : θ = 4Neµ
Kui 1 põlvkonna kohta tekib 1µ mutatsiooni (µ on mutatsioonikiirus) ja
koalestsentsipuul on keskmine oodatav aeg 2 liini ühinemiseni 2Ne
generatsiooni, siis keskmine oodatav mutatsioonide arv 2 järjestuse vahel on
2*2Neµ (sest 2 järjestust = 2 haru puul)
Iga koalestsentsi-intervalli (puu harupikkus 2N ühikutes) τ (tau) jooksul on
oodatav keskmine mutatsioonide arv 1 liinis
2Neµτ = τθ/2
Teeta väärtust saab hinnata keskmise paaride vahelise erinevuse π (pii) abil.
See on kõigi võimalike järjestuste paaride summa jagatud paaride arvuga.
Eeldusel, et kehtib lõputute saitide mudel
8. Selgita lühidalt, mis on “skyline” mudel populatsiooni efektiivse
suuruse hindamiseks.
Skyline koalesentsmudeli korral lävendist lühemad intervallid liidetakse
naabriga.
annaabi.ee 
