Imputeerimine
kindlaksmääramisel perekonnas. Vaadatakse rekombinatsiooni
esinemist ning alleelide jagunemist. Linkage analüüsi eesmärgiks on
uurida, kas geneetiline marker on seotud meid huvitava tunnusega.
Parametric linkage analysis – vaja tunnuse kohta midagi teada, kas
X-liiteline, retsessiivne, ka geenisagedust ning geeni penetrantsust.
Non-parametric – pärilikkuse mustrit ei tea.
55. Genoomi varieerumine, SNP markerid, haplotüübid ja
haploblokid. Komplekshaiguste eelsoodumusgeenide
kaardistamine ja identifitseerimine, kaksikute ja
adoptsiooniuuringud, aheldusanalüüs (linkage analysis),
assotsiatsioonianalüüs ja aheldumise mittetasakaalulisus LD
(linkage disequilibrium). Kogugenoomi
assotsiatsiooniuuringud (GWAS).
Lähedalasuvate lookuste pärandumine toimub blokkidena.
Haplotüüp on mingis kromosoomis lookuste alleelse koosseisu
aheldatus. Alleelid ühes väikeses kromosoomisegmendis
päranduvad blokina.