Biosüstemaatika teooria ja meetodid
erinevalt eelmistest, kuigi üsna odavatest, kätte saadav tasuta. Vähegi
suuremate andmemaatriksite jaoks on see programm aga (praeguses versioonis)
väga aeglane.
Kui oleme (näiteks PAUP-i abil) saanud mingi kladogrammi - hüpoteetilise
fülogeneesipuu, võime programmi MacClade abil otse ekraanil jälgida tun-
nuste muutumist puu harudes; võime oma suva järgi ümber tõsta puu harusid
või üksikuid taksoneid teise kohta ja vaadata, kuidas see mõjustab puu ko-
gupikkust.
8.6. Puude "ehitamisel" võime iga TS (tunnuste) kohta ette määrata, kui-
das see tohib muutuda. Tähistame järgnevaks seletuseks (binaarse transfor-
matsiooniseeria) tunnused kui 0 ja 1.
Dollo parsimoonia (kasutusel aastast 1974) puhul tähistame plesiomorfse
seisundi 0-ga. Võimalik on tunnuse ainult ühekordne muutumine 0 → 1 ja
mingit paralleelset sedapidi muutumist rohkem ei lubata. Tunnus võib tagasi
pöörduda (→ 0), kuid selliste muutuste arv on minimeeritud.