Mikroobifusioloogia
faasi alguses alarmooni kontsentratsioon tõuseb natuke ning jääb sellele
kontsentratsioonile stabiilselt kuni kasvukiiruse aeglustumiseni. Ses faasis
suureneb alarmooni kontsentratsioon järsult väga kõrgele ning langeb peagi
madalale kontsentratsioonile tagasi. Alarmooni sünteesib ribosoomiseoseline valk
RelA, mis aktiveerub siis kui ribosoomi A-taskusse siseneb aminohappeta tRNA,
mis on otseseks signaaliks, et rakus ei jätku aminohappeid valkude sünteesiks.
RelA sünteesib pppGpp (guanosiinpentafosfaati), mille katalüüsib ppGpp-ks
guanosiinpentafosfaadi fosfohüdrolaas GppA. Selle geeni transkriptsioon on
tugevalt represseeritud kui DNA globaalne negatiivne superspiralisatsioon
väheneb. Seega, kui rakud sisenevad statsionaarsesse kasvufaasi, siis ppGpp
süntees väheneb. Kui valkude süntees on stabiliseerunud (piisavalt aminohappeid
ribosoomide kohta), siis SpoT lagundab (p)ppGpp.
Alarmoonist sõltuvatel promootoritel on iseloomulik
annaabi.ee 
