Genoomi struktuur ja funktsioon
lisakriteeriumid võivad hõlmata seondumiskoha järjestuse mustreid, mis
soodustavad miRNA seondumist, erinevad sekundaarstruktuurid võivad mõjutada,
kõige olulisemaks on konserveeritus lähedaste ja kaguete liikide vahel. Mida
rohkem seondumiskoht on konserveerunud seda spetsiifilisemalt langeb see
miRNA seondumiskohta ja seda parem on tõendusmaterjal et seondumiskoht on
funktsionaalne.
•
• MikroRNAde toimemehhanismid
• miRNA toimib RISC kompleksis giidmolekulina, seondudes sihtmärk-mRNAle.
Selle seondumise tulemusena toimub geeni ekspressiooni reguleerimine
translatsiooni repressiooni või mRNA lagundamise kaudu. See millise mehhanismi
kaudu regulatsioon toimub, sõltub miRNA seed järjestuse ja mRNA 3’UTR
vahelise komplementaarsuse astmest. Täieliku komplementaarsuse korral toimub
mRNA lagunamine, osalise komplementaarsuse puhul aga mRNA translatsiooni
inhibeerimine. Taimedel on enamasti mRNA lagundamine, loomade puhul on
annaabi.ee 
