“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
Süvasekventsiga määratakse ribosoomidega seotud
mRNA osad, mis näitab translatsioooni dünaamikat mRNA-l. Kaitstud fragmentide
sagedus peegeldab konkreetse piirkonna translatsiooni kiirust. Rakkudest eraldatakse
polüsoomid. Ribosoome töödeldakse ribonukleaasiga. Tekivad 36-40 nt pikkused
fragmendid, mis suunatakse sekveneerimisse. Kõik sobivate pikkustega fragmentide
järjestused saadakse teada ja paigutakse genoomidesse. Vaadates palju sarnaseid
fragmente on, saame määrata nende aktiivsuse tase. Mida rohkem ühte lõiku, seda
aeglasem on sealkohal translatsioon. Saame ribosoomide profiili mRNA-de peal.
Töödeldes polüsoome nukleaasiga, muutuvad nad kõik 70S-ks. Kui mRNA sisaldab
Shine-Dalgamo järjestsutega sarnased, siis jääb sel kohal translatsioon seisma, katkeb.
Kvantitatiivne mass-spemktromeetria valgusünteesi uurimisel
annaabi.ee 
